Aおそらく男性社会の中で女性らしさまでは失わないようにとの配慮ではないかと。
あと女性にも、ノーメイクはダメとか濃すぎるメイクはダメなど、身だしなみについて一定の基準はあり、ある意味男性より厳しいです。当然ですが守れない人には上官からの叱責があります。

あなたの論理だと、制服のスカートやパンプスを女性だけが強要されていて、男性がスカートやパンプスを履かないのは女性差別だとなりませんか？